Iki 1927 m. Viečiūnų kaime atidaryta pirmoji pradinė mokykla, kurioje dirbo mokytojai Kazlauskas ir Sinkevičius. Senosios mokyklos patalpos buvo ankštokos, nebuvo sporto salės, tačiau čia mokėsi nemažai mokinių. Iškilo būtinybė statyti naują, didesnę, erdvesnę mokyklą. Mokytojos Onos Zakarauskienės iniciatyva ir pastangomis 1984 m. pastatyta dabartinė mokykla.
Mokyklos veiklos pradžia: 1984-09-01.
Nuo 2012 m. rugpjūčio 29 d. mokykla turi ikimokyklinio ugdymo skyrių „Linelis“, kuris tęsia 1972 m. spalio 25 d. įsteigto Druskininkų savivaldybės Viečiūnų vaikų lopšelio-darželio „Linelis“ veiklą (Druskininkų savivaldybės tarybos 2012 m. balandžio 26 d. sprendimas Nr. T1-105 „Dėl Druskininkų savivaldybės Viečiūnų vaikų lopšelio-darželio „Linelis“ reorganizavimo prijungimo būdu prie Druskininkų savivaldybės Viečiūnų pagrindinės mokyklos“).
Nuo 2017 m. rugsėjo 1 d. pertvarkyta Druskininkų savivaldybės Viečiūnų pagrindinės mokyklos vidaus struktūra, nutraukiant pagrindinio ugdymo programos antrosios dalies vykdymą ir pakeičiant mokyklos tipą į progimnazijos tipą, šią mokyklą pavadinant Druskininkų savivaldybės Viečiūnų progimnazija. (Druskininkų savivaldybės tarybos 2017 m. vasario 28 d. sprendimas Nr. T1-40 „Dėl Druskininkų savivaldybės Viečiūnų pagrindinės mokyklos vidaus struktūros pertvarkos ir Druskininkų savivaldybės Viečiūnų progimnazijos nuostatų tvirtinimo").
Mokyklos vadovai:
1989–2004 m. mokyklai vadovavo direktorius Algis Bolys.
2004–2018 m. mokyklai vadovavo direktorė Elvyra Česnulevičienė.
Nuo 2018-11-19 iki 2022-12-31 progimnazijai vadovavo direktorė Žaneta Krivonienė.
Nuo 2023-01-09 iki 2023-08-20 progimnazijos direktoriaus funkcijas laikinai vykdė direktoriaus pavaduotojas ūkiui Jonas Markevičius.
Nuo 2023-08-21 progimnazijai vadovauja direktorė Ieva Kadziauskienė.
Atnaujinta: 2024-02-28
